標籤彙整:PRISMA

meta-analysis_20240615_0579
2024 / 6 / 21

那些學術界不會公開的秘密,新思惟偷偷跟你說。

 

作者:台中榮總 大腸直腸外科 林志安 醫師

 

 

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新思惟的課程,從 PGY 時期就經常在同事、周遭朋友中口耳相傳著,社群媒體上也不時看到。埋頭於繁忙的臨床工作裡,便逐漸忘了有這麼一門課。升上主治醫師之後,在醫學中心面臨論文及升等的壓力,無意間看到難得在台中開班授課,於是鼓起勇氣報名!

 

 

老師帶著寫過一篇統合論文,自己卻還是懵懵懂懂。

 

住院醫師時期,在醫院老師的帶領之下發表過一篇 meta-analysis。從文獻搜尋到評讀,老師提供很多資料供我閱讀,花費了不少時間,後續的統計和投稿問題,雖然老師人很好,幫我完成部份的工作。最後文章成功刊登,十分感謝老師,但總覺得不踏實,心想有朝一日我也是要自己獨力完成的吧,不能總一輩子麻煩人家或賴著老師,成為我這次報名的最大契機。

 

在一開始報名時大家的疑問,行前便提供了詳細的 QA 文件為我們解惑,搭配課前閱讀的資料,就能看出課程團隊的用心。上課當天,蔡校長先揭示了圖表重要性,用簡單的語言,把 PRISMA、Forest plot 到 funnel plot 的概念講得很清楚,除此之外,也說明了圖表排列順序的重要性,就像打牌 combo 一樣需要技巧。

 

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Meta-analysis_20190505_1622
2023 / 5 / 4

環境變化快速,幸好有蔡校長提供的課後諮詢管道。

 

 

作者:邱家佑 醫師(The University of Texas Health Science Center at Houston / The University of Texas MD Anderson Cancer Center)

相關文章:[快訊] 邱家佑醫師團隊,關於免疫受損且無 HIV 感染者使用靜脈注射潘他密汀預防性治療肺囊蟲肺炎之統合分析,獲 Journal of Fungi 刊登!

 

 

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這是我第四個做的 meta-analysis,第一個跟第二個已經發表,第三個則是做成 meeting poster 沒有發表。距離上次做 meta-analysis 已經是 2020 年,想不到 meta-analysis 的世界有天翻地覆的變化,原來 PRISMA 在 2020 出了新版的指引,我並沒有細看跟了解。

 

但因為經常關注新思惟臉書社團和蔡校長的個人帳號,知道新思惟針對 meta-analysis 課程有進行大改版,原先的課程範例論文,也改為兩個蔡校長自己寫的範例,因此我在剛開始寫這篇時,稍微看了一下新範例有什麼不同,但只覺得「看起來好像差不多」,做的時候還是用我以前 PRISMA 2009 的方式來進行,想著之前好歹也發表過兩篇 meta-analysis,應該依樣畫葫蘆就可以。

 

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2022 / 4 / 21

來上《統合分析工作坊》,統計不求人、IRB 也不必擔心!

 

作者:林口長庚 神經外科 李丞騏 醫師

 

 

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2022 年 4 月 16 日這一天,大約隔了六年,再次來到集思會議中心,這些年的變化實在巨大(生兩個小孩、博班畢業、出國短期進修兩次、升等助理教授、買房等 XD),尤其在經歷了 COVID-19 之後,很佩服蔡校長始終如一的堅持與熱情。

 

在 FB 上追蹤新思惟已久,每每看到論文發表成績或是課程相關資訊,對於學員滿滿的收穫以及精彩的製圖都心生嚮往。課後自己也有同樣的感受,更開心能獲得製圖大獎

 

 

雖有發表,仍不想被統計或資源侷限。

 

其實我並非論文發表初學者,但產量不穩定,所幸以往還有不錯成績,去年也幸運得以申請院內晉升(希望會過 XD),但為何還選擇參加工作坊?就是因為臨床資源資料取得不易,從收集到分析到寫作完成,至少一年半載,更別說如果投傳統期刊,少則半年的往來才能發表 ><。

 

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2018 / 1 / 15

2018 / 1 / 14(日)「統合分析製圖大賽」得獎作品:楊昀儒醫師、翁騰崧藥師

 

 

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本梯次,有不少藥師、護理師等醫療人員參與,也有電腦稍微比較不熟的朋友。在助教群的積極協助下,每位同學都能順利做出漂亮的投稿圖表!

 

上傳參賽的作品,品質都很高,所以花了些時間評選,差點來不及印獎狀。以下,說明各位同學已經很棒的作品,為什麼差一點點得獎,以及最終獲獎的楊昀儒醫師翁騰崧藥師的作品,為什麼特別好?

 

 

可能會忽略的細節

 

 

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Z-Value 為中間產物,p-Value 其實看有沒有過中線就知道,建議去掉。另外,有幾位同學,都是一開始兩張記得刪除 Z-Value 與 p-Value,但後兩張卻忘了刪,造成 internal inconsistency(內部不一致性),建議修正。

 

 

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Study 與 summary 的黑色一致。在這位作者的其他張,其實他是有做灰階層次的,但這張忽略了,結果變成全黑。

 

 

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數字的對齊建議盡量讓小數點對齊,但如果操作上有困難,這兩欄數字或可考慮置中,也比靠左來得好。

 

 

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倒數第三行的 to 後方少了一個空格。最後一列為空行,建議刪除。

 

 

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數字靠右的確不錯,但 SMD 一欄,靠右的話,會顯得左邊負空間太大。95% CI 一欄,因為有 to 在中間的關係,建議置中即可。靠右則會因為 to 的位置跑來跑去,顯得混亂。

 

這些圖片細節的鍛鍊,需要多操作、多練習、多研究才會好。剛好現在 CMA 正熱烈團購中,1/18(四)截止,有興趣的朋友,歡迎一起上車!

 

 

 

楊昀儒醫師

 

 

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楊昀儒醫師上傳的,是純以灰階對決的作品中,細節注意得最好的,以這張優秀的 forest plot 來說,我並沒有進一步建議。

 

 

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分組的 subgroup analysis,畫面處理得非常理想,顏色、文字、行距列距等常見的問題,在作品中都沒有!

 

 

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Funnel plot 也一樣簡單精彩。可惜 X/Y 軸的數字略小,建議可以嘗試看看,是否能再做大一些。

 

非常不錯的作品,是灰階組的典範,恭喜楊昀儒醫師!

 

 

翁騰崧藥師

 

 

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翁騰崧藥師的作品,一上傳就知道有備而來,他把過去的得獎作品都看過,知道做圖如果能做「一整套」,而且細節都處理好,得獎幾乎是確定的。

 

騰崧因為擔心自己是藥師訓練出身,並非醫師背景,在上課前很擔心吸收不良,但也因為這樣的擔心,讓他作了非常多的課前預習,除了看過所有得獎作品之外,收到課前通知之後,就嘗試開始處理數據,並試著做圖!

 

這張 PRISMA 雖然是用課程送給大家的範本去修改,但他的確作了不少改動,包括把 n 值放到前面,以及右下角的排除條款中,總數目的第一行置中。雖然這些改動不見得是最好的設計,但也表示他嘗試處理出自己的風格!

 

目前的作法,其缺點是,n 值數字靠左,這比較可惜,靠右對齊個位數會更好。總共排除 7 篇,也建議靠左,使他層級明顯比下頭的 4 / 2 / 1 說明更高些。

 

不過這些都是很細微的建議了,也並不是太顯著的問題。

 

 

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Forest plot 的部分,他使用偏粉彩的顏色,是比我們範本更淺的橘色和灰色,可能騰崧年紀輕,依然有少女心 XD 這也很好。目前所選的顏色,並不至於太淡,算是剛好可以接受的程度。很棒。

 

 

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分組的 subgroup analysis 也沒問題,畫面處理、文字大小、行距列距等,都很不錯。恰當!

 

 

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Funnel plot 比較可惜了一點,除了同樣的 X/Y 軸數字偏小的問題之外,他選擇將圈圈填滿橘色,這動機是好,但填好之後,黑色框仍在,變成像是「漆彈」,皮脆心軟又好嚼。帶框的設計,與之前 forest plot 的 summary 符號設計明顯不同。建議乾脆讓橘色圓點擴大,把框給蓋過去也不錯。

 

 

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更用心的是,他重新處理過表格,這張大表,他應該在課前就先準備了,因為早上一到教室時,他就跟我說了一個表格內的小錯誤,真的看得很仔細!XD

 

 

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小表格的處理一樣很棒,我猜想他是用之前得獎者曾經使用的「白色負號」秘訣去處理對齊。這方法雖然可行,我個人並不是太建議,主要的原因是,日後被接受,如果 copy editor 複製你表格的內容重製的話,那個「看不見的負號」會被複製到,導致最終的文字有誤,一旦 proof reading 沒看到這麼細,印出來就百世流芳了 XD

 

建議還是乾脆直接全部置中,一點點的不對齊還能接受,這是範本的作法。如果真要非常對齊的話,就必須細分成三個欄位,分別填入兩組數值與中間的 to 才能達成了。

 

騰崧的作品非常完整、保留彩色、且實際操作過每個細節,需要再建議的也不多,得獎實至名歸。這樣程度的用心,reviewer 一定會看得到的!恭喜,也祝投稿順利!

 

 

最新活動

 

 

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2017 / 3 / 17

我終於等到你,統合分析工作坊!

 

作者:匿名

 

 

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秒殺版竟然被我搶到,太幸運了!

 

這是我第二次上新思惟的課程,竟然能夠搶到秒殺版的統合分析工作坊,實在是不勝榮幸 XD 這一堂《統合分析工作坊》延續了新思惟一向的傳統,從一走進教室開始,就令人感到無比愉快,無論是網路速度、電源配置及桌面大小使用上都十分舒適,馬克杯上的全新圖案,令咖啡喝起來更顯美味 XD

 

網路上有人說,「上新思惟的課會上癮,變成一種戒不掉的自我投資。」也許吧,集思台大會議中心的咖啡香,或許真的改變了很多人的人生態度和方向。(從教室後方放眼望去,各種型號的 MacBook、Microsoft Surface 及各家頂規筆電,就知道這是新思惟之友的地方,我沒走錯 XD)

 

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2016 / 11 / 25

互動實作時間:完成一套 Meta-analysis 圖表

 

指導:新思惟講師助教群

 

 

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學習目標

 

這次,互動實作時間的學習目標,是做出「指定論文」的「整套圖表」。對,你沒看錯,就是「整套」。

 

  • Figure 1 我們提供設計好的 PRISMA 範本,您稍加修改即可適用於自己的研究。
  • Table 1 與 Table 2,描述性的內容,您自己也能做。
  • Figure 2a, 2b, 3a, 3b 的 Forest plot 以及 Figure 4a, 4b 的 Funnel plot。加上 Table 3 的 subgroup analysis。您都能「親手」在自己的電腦上,做出來!

 

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