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2018 / 5 / 15

統合分析工作坊 Q&A 精選

 

 

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最新活動

 

 

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2018 / 3 / 12

2018 / 3 / 11(日)「統合分析製圖大賽」得獎作品:姚智國醫師、魏君卉醫師

 

 

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這梯次的互動實作時間,可能是有史以來全班舉手最踴躍的一次,每一位同學對自己的要求都很高,會去注意到自己的作品與範例有何不同,並努力找出調整的介面與方式。我們的講師與助教也很榮幸能在這段時間協助各位,實際在各位的電腦搞定這些細節。

 

上傳的作品,每份都很不錯,最後,就是根據「誰犯的錯比較少」以及「誰的作品讓 reviewer 這樣滑過去,不會有什麼意見」的兩個標準,來評選。

 

在介紹得獎的姚智國醫師與魏君卉醫師作品前,我們一樣先來看看,那些差點得獎的作品,有哪些常見的細節,可以建議。

 

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2018 / 2 / 14

[快訊] 雷偉德醫師探討益生菌或益菌生是否有助於增進流感疫苗效用之統合分析,獲 Drug Design, Development and Therapy 刊登!

 

 

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文章介紹

 

雷醫師參與團隊曾以統合分析探討益生菌(probiotics)或益菌生(prebiotics)能否增進流感疫苗(influenza vaccination)的保護力,研究發現益生菌或益菌生能提升成人接種流感疫苗後的 immunogenicity(引發免疫功能的能力)。

 

本篇同時進行的系列研究則探討:益生菌或益菌生對於接種流感疫苗後的 antibody titer 影響如何,同樣以系統性文獻回顧與統合分析為研究方式。

 

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2018 / 1 / 15

2018 / 1 / 14(日)「統合分析製圖大賽」得獎作品:楊昀儒醫師、翁騰崧藥師

 

 

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本梯次,有不少藥師、護理師等醫療人員參與,也有電腦稍微比較不熟的朋友。在助教群的積極協助下,每位同學都能順利做出漂亮的投稿圖表!

 

上傳參賽的作品,品質都很高,所以花了些時間評選,差點來不及印獎狀。以下,說明各位同學已經很棒的作品,為什麼差一點點得獎,以及最終獲獎的楊昀儒醫師翁騰崧藥師的作品,為什麼特別好?

 

 

可能會忽略的細節

 

 

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Z-Value 為中間產物,p-Value 其實看有沒有過中線就知道,建議去掉。另外,有幾位同學,都是一開始兩張記得刪除 Z-Value 與 p-Value,但後兩張卻忘了刪,造成 internal inconsistency(內部不一致性),建議修正。

 

 

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Study 與 summary 的黑色一致。在這位作者的其他張,其實他是有做灰階層次的,但這張忽略了,結果變成全黑。

 

 

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數字的對齊建議盡量讓小數點對齊,但如果操作上有困難,這兩欄數字或可考慮置中,也比靠左來得好。

 

 

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倒數第三行的 to 後方少了一個空格。最後一列為空行,建議刪除。

 

 

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數字靠右的確不錯,但 SMD 一欄,靠右的話,會顯得左邊負空間太大。95% CI 一欄,因為有 to 在中間的關係,建議置中即可。靠右則會因為 to 的位置跑來跑去,顯得混亂。

 

這些圖片細節的鍛鍊,需要多操作、多練習、多研究才會好。剛好現在 CMA 正熱烈團購中,1/18(四)截止,有興趣的朋友,歡迎一起上車!

 

 

 

楊昀儒醫師

 

 

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楊昀儒醫師上傳的,是純以灰階對決的作品中,細節注意得最好的,以這張優秀的 forest plot 來說,我並沒有進一步建議。

 

 

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分組的 subgroup analysis,畫面處理得非常理想,顏色、文字、行距列距等常見的問題,在作品中都沒有!

 

 

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Funnel plot 也一樣簡單精彩。可惜 X/Y 軸的數字略小,建議可以嘗試看看,是否能再做大一些。

 

非常不錯的作品,是灰階組的典範,恭喜楊昀儒醫師!

 

 

翁騰崧藥師

 

 

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翁騰崧藥師的作品,一上傳就知道有備而來,他把過去的得獎作品都看過,知道做圖如果能做「一整套」,而且細節都處理好,得獎幾乎是確定的。

 

騰崧因為擔心自己是藥師訓練出身,並非醫師背景,在上課前很擔心吸收不良,但也因為這樣的擔心,讓他作了非常多的課前預習,除了看過所有得獎作品之外,收到課前通知之後,就嘗試開始處理數據,並試著做圖!

 

這張 PRISMA 雖然是用課程送給大家的範本去修改,但他的確作了不少改動,包括把 n 值放到前面,以及右下角的排除條款中,總數目的第一行置中。雖然這些改動不見得是最好的設計,但也表示他嘗試處理出自己的風格!

 

目前的作法,其缺點是,n 值數字靠左,這比較可惜,靠右對齊個位數會更好。總共排除 7 篇,也建議靠左,使他層級明顯比下頭的 4 / 2 / 1 說明更高些。

 

不過這些都是很細微的建議了,也並不是太顯著的問題。

 

 

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Forest plot 的部分,他使用偏粉彩的顏色,是比我們範本更淺的橘色和灰色,可能騰崧年紀輕,依然有少女心 XD 這也很好。目前所選的顏色,並不至於太淡,算是剛好可以接受的程度。很棒。

 

 

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分組的 subgroup analysis 也沒問題,畫面處理、文字大小、行距列距等,都很不錯。恰當!

 

 

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Funnel plot 比較可惜了一點,除了同樣的 X/Y 軸數字偏小的問題之外,他選擇將圈圈填滿橘色,這動機是好,但填好之後,黑色框仍在,變成像是「漆彈」,皮脆心軟又好嚼。帶框的設計,與之前 forest plot 的 summary 符號設計明顯不同。建議乾脆讓橘色圓點擴大,把框給蓋過去也不錯。

 

 

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更用心的是,他重新處理過表格,這張大表,他應該在課前就先準備了,因為早上一到教室時,他就跟我說了一個表格內的小錯誤,真的看得很仔細!XD

 

 

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小表格的處理一樣很棒,我猜想他是用之前得獎者曾經使用的「白色負號」秘訣去處理對齊。這方法雖然可行,我個人並不是太建議,主要的原因是,日後被接受,如果 copy editor 複製你表格的內容重製的話,那個「看不見的負號」會被複製到,導致最終的文字有誤,一旦 proof reading 沒看到這麼細,印出來就百世流芳了 XD

 

建議還是乾脆直接全部置中,一點點的不對齊還能接受,這是範本的作法。如果真要非常對齊的話,就必須細分成三個欄位,分別填入兩組數值與中間的 to 才能達成了。

 

騰崧的作品非常完整、保留彩色、且實際操作過每個細節,需要再建議的也不多,得獎實至名歸。這樣程度的用心,reviewer 一定會看得到的!恭喜,也祝投稿順利!

 

 

最新活動

 

 

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2017 / 11 / 6

準備好的人才會遇到機緣,也才抓的住機會。

 

作者:新竹馬偕 小兒過敏免疫風濕科 雷偉德 醫師

相關文章:[快訊] 雷偉德醫師以統合分析研究探討 probiotics、prebiotics 與成人接種流感疫苗效用之論文,獲 Nutrients 刊登!

 

 

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水到,就會渠成!

 

從上課後的滿腦子想法,到實際搜尋文獻、跑統計、看出可切入的點,然後寫文章、改文章、再加跑統計,這每一個環節看起來容易、但做起來有好多眉角要注意。

 

最後,當信箱出現「Accepted for publication」時,心中有股莫名的感動,這幾個月的辛苦沒有白費。而這一切的開端,都是在上完課後,快速取得基本且必要的技能後開始的。

 

 

機會總在無意中出現,而且就在身邊。

 

某個看完診的下午,強者同學捎來訊息問我:「最近我也在搞統合分析,看你有去上課,剛好這裡有個主題,要不要來合作?」

 

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2017 / 11 / 6

[快訊] 雷偉德醫師以統合分析研究探討 probiotics、prebiotics 與成人接種流感疫苗效用之論文,獲 Nutrients 刊登!

 

 

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文章介紹

 

益生菌(probiotics)是指可改善腸內微生態平衡、對生命有益的活性微生物,初步研究顯示補充益生菌對免疫系統、腸道健康有正面效益。益菌生(prebiotics)則是指可刺激腸內好菌生長的「營養素」,包含膳食纖維、菊糖和寡糖等。

 

流感疫苗(influenza vaccination)的保護效果約 70% 到 90%,但在大於 65 歲的族群則只有 30% 到 40%,推測可能與免疫衰老(immunosenescence)有關。

 

目前雖已有數篇 randomized controlled trials 探討 probiotics 或 prebiotics 能否增進流感疫苗之保護力,但文獻上尚欠缺系統性文獻回顧,因此作者團隊針對此議題進行系統性文獻回顧以及統合分析。

 

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